Yusandou a été fondée en 2009 lorsque Ryotaro Isozaki, son président, tout juste diplômé de l'université, a découvert Hideaki Natural Farming. Après avoir étudié la philosophie orientale à l'université, il recherchait un mode de vie où la nature et l'humain vivaient en harmonie. L'agriculture naturelle correspondait parfaitement à son mode de vie et à la philosophie qu'il recherchait. Il a été séduit par cette méthode agricole, qui n'utilise ni engrais ni pesticides et mise sur la force et l'amour de la terre.
Après avoir travaillé comme membre du personnel et ingénieur d'une organisation, il a commencé à expérimenter sérieusement les méthodes d'agriculture naturelle de Hideaki en 2014 sous le nom de Yusandou.
Yusandou Co., Ltd. a été créée en octobre 2016.